Создан в 2002 году для координации деятельности отраслевых предприятий, представительства их в органах власти, зашиты общих интересов. Учредители союза: «ФКК «Росхлебопродукт», «Фирма Комбикорма», «Агрокомбикорм», «Воронежский экспериментальный комбикормовый завод» и Всероссийский научно-исследовательский институт комбикормовой промышленности (ВНИИКП). Первым президентом союза стал Леонид Ахкозов, бывший начальник Главного управления комбикормовой промышленности Министерства хлебопродуктов РСФСР. С 2007 года союз возглавляет Валерий Афанасьев, генеральный директор ВНИИКП.
Цели и задачи союза комбикормщиков: создание условий для устойчивого функционирования комбикормовых предприятий; обеспечение высокоэффективными комбикормами животноводства, птицеводства и рыбоводства; повышение качества комбикормовой продукции, снижение ее себестоимости; содействие инвестированию в строительство новых и модернизации действующих комбикормовых предприятий; разработка и внедрение новых стандартов качества и технических регламентов на комбикормовую продукцию и сырье и др. Для реализации этих задач союз взаимодействует с правительством страны, региональными органами государственной власти, отраслевыми союзами и ассоциациями и т. д.