Основана в 1994 году предпринимателем из Германии Штефаном Дюрром; материнская компания — Ekosem-Agrar (Германия). С 1996 года «ЭкоНива» поставляет на российский рынок импортную сельхозтехнику, с 2002-го занимается агропроизводством. В 2011 году «ЭкоНива» разделилась на два самостоятельных холдинга: «ЭкоНиваТехника-Холдинг» (поставка импортной сельхозтехники; сервисное обслуживание; запасные части. Компания является крупнейшим дилером John Deere в России и Европе.) и «ЭкоНива-АПК Холдинг» (молочное и мясное животноводство; растениеводство; профессиональное семеноводство).
Агрохолдинг работает в Воронежской, Курской, Московской, Ленинградской, Новосибирской, Калужской, Рязанской, Оренбургской, Самарской и Тюменской областях, а также в Республиках Татарстан, Башкортостан и Алтайском крае. Общий земельный банк - 630 тыс. га. В 2020 году валовой сбор зерна составил 731 тыс. т (включая кукурузу на зерно). Приоритетное направление холдинга — молочное животноводство. Компания является крупнейшим производителем молока в России и Европе. В 2020 году валовый надой составил 925 тыс. т. Общее стадо КРС — 216 тыс., в том числе 111,5 тыс. фуражных коров. Кроме того, компания занимается мясным скотоводством (9,7 тыс. КРС).
С 2006 года животноводческие предприятия «ЭкоНивы» занимаются племенной работой по разведению КРС. Статусы племенных репродукторов и племзаводов имеют хозяйства Воронежской, Курской, Калужской и Новосибирской областей. Разводимые породы: симментальская, бурая швицкая, голштинская черно-пестрой масти, красно-пестрая, герефордская.
Семеноводческое подразделение компании производит порядка 70 тыс./год сертифицированных семян зерновых, зернобобовых, многолетних и однолетних трав отечественной и зарубежной селекции.
В 2012 году «ЭкоНива-АПК Холдинг» дважды успешно разместила облигационный займ на Штутгартской фондовой бирже на общую сумму 110 млн евро. По итогам 2020 года выручка «ЭкоНивы» составила 38,3 млрд руб., чистая прибыль — 2,6 млрд руб., рентабельность по EBITDA — 32%.