Образована в 1993 году, крупный частный инвестор в реальный сектор экономики. Инвестиционный портфель АФК «Система» состоит преимущественно из российских компаний в различных секторах, включая телекоммуникации, энергетику, розничную торговлю, высокие технологии, лесозаготовку и лесопереработку, фармацевтику, медицинские услуги, железнодорожные перевозки, сельское хозяйство, финансы, масс-медиа, туризм и прочие. Акции компании находятся в обращении на Лондонской фондовой бирже (LSE) в виде глобальных депозитарных расписок под тикером «SSA». Акции компании также допущены к торгам на Московской бирже под тикером «AFKS».
Бизнес АФК «Система» в сельском хозяйстве представлен совместным предприятием RZ Agro («РЗ Агро») и группой компаний «Степь». Общий земельный банк предприятий — около 247 тыс. га с учетом купленных в 2016 году примерно 110 тыс. га. К 2018 году компания планирует увеличить его минимум до 500 тыс. га.
Консолидированная выручка АФК «Система» за первый квартал 2016 года составила 173,3 млрд руб., что на 5,6 млрд руб. больше, чем за первый квартал 2015-го.